Das Direktorium setzt sich aus den Direktor*innen der Forschungsbereiche zusammen, die als Professorinnen und Professoren an
Universitäten tätig sind. Sie haben sich den Transfer ihrer Forschungsergebnisse in die Wirtschaft als Ziel gesetzt und nutzen dazu
die Infrastruktur des FZI. Zudem berät das Direktorium den Vorstand zur internen Wissenschafts- und Forschungspolitik sowie bei der Forschungs-, Ausbau- und Finanzplanung. Das Direktorium steht außerdem den Forschungsbereichen bei ihren Tätigkeiten mit Rat zur Seite.