Jan Novacek studierte Informatik am Karlsruher Institut für Technologie (KIT). Seine Hauptfächer waren Software-Engineering und Anthropomatik.
Ab 2009 war er als Hilfswissenschaftler am FZI Forschungszentrum Informatik tätig, seit 2015 als Gastwissenschaftler und seit 2016 als wissenschaftlicher Mitarbeiter am FZI in der Abteilung Systementwurf in der Mikroelektronik (SiM).
Im Jahr 2023 promovierte er an der Universität Tübingen über die Ontologie-gesützte Optimierung des Entwurfs von automobilelektronischen Systemen bei Prof. Dr. Oliver Bringmann.